Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PPLO60437 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PPLO60437 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PPLO60437 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PPLO60437 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PPLO60437 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PPLO60437 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PPLO60437 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PPLO60437 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PPLO60437 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PPLO60437 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PPLO60437 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PPLO60437 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PPLO60437 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PPLO60437 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PPLO60437 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PPLO60437 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PPLO60437 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PPLO60437 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PPLO60437 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PPLO60437 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PPLO60437 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PPLO60437 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PPLO60437 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PPLO60437 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PPLO60437 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PPLO60437 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PPLO60437 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PPLO60437 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PPLO60437 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PPLO60437 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
PPLO60437 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
PPLO60437 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PPLO60437 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PPLO60437 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PPLO60437 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PPLO60437 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PPLO60437 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PPLO60437 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
PPLO60437 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PPLO60437 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PPLO60437 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PPLO60437 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PPLO60437 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PPLO60437 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PPLO60437 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PPLO60437 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PPLO60437 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PPLO60437 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PPLO60437 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PPLO60437 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PPLO60437 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PPLO60437 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PPLO60437 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PPLO60437 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PPLO60437 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PPLO60437 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PPLO60437 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PPLO60437 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PPLO60437 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PPLO60437 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PPLO60437 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PPLO60437 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PPLO60437 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PPLO60437 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PPLO60437 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PPLO60437 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PPLO60437 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PPLO60437 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PPLO60437 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PPLO60437 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PPLO60437 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PPLO60437 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PPLO60437 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PPLO60437 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PPLO60437 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PPLO60437 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PPLO60437 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PPLO60437 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PPLO60437 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PPLO60437 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PPLO60437 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PPLO60437 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PPLO60437 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PPLO60437 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PPLO60437 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PPLO60437 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PPLO60437 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PPLO60437 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PPLO60437 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PPLO60437 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PPLO60437 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PPLO60437 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PPLO60437 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PPLO60437 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PPLO60437 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PPLO60437 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PPLO60437 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PPLO60437 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PPLO60437 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms