Protein–RNA interactions for Protein: O60232

SSSCA1, Sjoegren syndrome/scleroderma autoantigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSSCA1O60232 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSSCA1O60232 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSSCA1O60232 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSSCA1O60232 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SSSCA1O60232 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSSCA1O60232 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSSCA1O60232 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSSCA1O60232 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSSCA1O60232 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSSCA1O60232 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSSCA1O60232 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSSCA1O60232 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSSCA1O60232 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSSCA1O60232 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSSCA1O60232 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSSCA1O60232 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSSCA1O60232 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSSCA1O60232 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSSCA1O60232 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSSCA1O60232 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSSCA1O60232 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSSCA1O60232 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSSCA1O60232 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSSCA1O60232 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSSCA1O60232 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSSCA1O60232 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSSCA1O60232 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSSCA1O60232 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSSCA1O60232 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSSCA1O60232 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSSCA1O60232 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSSCA1O60232 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSSCA1O60232 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSSCA1O60232 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSSCA1O60232 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSSCA1O60232 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSSCA1O60232 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSSCA1O60232 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSSCA1O60232 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSSCA1O60232 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSSCA1O60232 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSSCA1O60232 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSSCA1O60232 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SSSCA1O60232 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSSCA1O60232 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSSCA1O60232 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSSCA1O60232 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSSCA1O60232 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSSCA1O60232 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSSCA1O60232 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSSCA1O60232 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSSCA1O60232 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSSCA1O60232 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSSCA1O60232 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSSCA1O60232 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSSCA1O60232 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSSCA1O60232 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SSSCA1O60232 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSSCA1O60232 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSSCA1O60232 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SSSCA1O60232 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSSCA1O60232 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSSCA1O60232 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSSCA1O60232 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSSCA1O60232 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSSCA1O60232 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSSCA1O60232 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSSCA1O60232 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSSCA1O60232 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSSCA1O60232 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SSSCA1O60232 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSSCA1O60232 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSSCA1O60232 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSSCA1O60232 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSSCA1O60232 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSSCA1O60232 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSSCA1O60232 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSSCA1O60232 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSSCA1O60232 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSSCA1O60232 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSSCA1O60232 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSSCA1O60232 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSSCA1O60232 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SSSCA1O60232 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SSSCA1O60232 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSSCA1O60232 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSSCA1O60232 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSSCA1O60232 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSSCA1O60232 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSSCA1O60232 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSSCA1O60232 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSSCA1O60232 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSSCA1O60232 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSSCA1O60232 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSSCA1O60232 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSSCA1O60232 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSSCA1O60232 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSSCA1O60232 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSSCA1O60232 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSSCA1O60232 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms