Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms