Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms