Protein–RNA interactions for Protein: O43541

SMAD6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6O43541 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMAD6O43541 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMAD6O43541 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMAD6O43541 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMAD6O43541 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SMAD6O43541 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMAD6O43541 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMAD6O43541 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMAD6O43541 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMAD6O43541 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMAD6O43541 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMAD6O43541 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMAD6O43541 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMAD6O43541 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMAD6O43541 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMAD6O43541 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMAD6O43541 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMAD6O43541 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMAD6O43541 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMAD6O43541 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMAD6O43541 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMAD6O43541 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMAD6O43541 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMAD6O43541 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMAD6O43541 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMAD6O43541 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMAD6O43541 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMAD6O43541 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMAD6O43541 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMAD6O43541 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMAD6O43541 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMAD6O43541 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMAD6O43541 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMAD6O43541 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SMAD6O43541 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMAD6O43541 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMAD6O43541 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMAD6O43541 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMAD6O43541 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMAD6O43541 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMAD6O43541 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMAD6O43541 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMAD6O43541 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMAD6O43541 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMAD6O43541 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMAD6O43541 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMAD6O43541 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMAD6O43541 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMAD6O43541 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMAD6O43541 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMAD6O43541 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMAD6O43541 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMAD6O43541 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMAD6O43541 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMAD6O43541 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMAD6O43541 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMAD6O43541 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMAD6O43541 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMAD6O43541 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMAD6O43541 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SMAD6O43541 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMAD6O43541 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMAD6O43541 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SMAD6O43541 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMAD6O43541 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMAD6O43541 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMAD6O43541 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMAD6O43541 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMAD6O43541 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMAD6O43541 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMAD6O43541 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMAD6O43541 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMAD6O43541 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMAD6O43541 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMAD6O43541 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMAD6O43541 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMAD6O43541 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMAD6O43541 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMAD6O43541 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SMAD6O43541 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMAD6O43541 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMAD6O43541 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMAD6O43541 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMAD6O43541 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMAD6O43541 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMAD6O43541 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMAD6O43541 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMAD6O43541 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMAD6O43541 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMAD6O43541 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMAD6O43541 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMAD6O43541 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMAD6O43541 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMAD6O43541 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMAD6O43541 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMAD6O43541 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMAD6O43541 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMAD6O43541 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMAD6O43541 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMAD6O43541 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms