Protein–RNA interactions for Protein: O43526

KCNQ2, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 2, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ2O43526 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNQ2O43526 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNQ2O43526 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNQ2O43526 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNQ2O43526 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNQ2O43526 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNQ2O43526 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNQ2O43526 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNQ2O43526 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNQ2O43526 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNQ2O43526 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNQ2O43526 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNQ2O43526 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNQ2O43526 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNQ2O43526 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNQ2O43526 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNQ2O43526 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNQ2O43526 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNQ2O43526 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNQ2O43526 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNQ2O43526 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNQ2O43526 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNQ2O43526 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNQ2O43526 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNQ2O43526 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNQ2O43526 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNQ2O43526 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNQ2O43526 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNQ2O43526 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNQ2O43526 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNQ2O43526 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNQ2O43526 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNQ2O43526 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNQ2O43526 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNQ2O43526 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNQ2O43526 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNQ2O43526 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNQ2O43526 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNQ2O43526 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNQ2O43526 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNQ2O43526 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNQ2O43526 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNQ2O43526 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNQ2O43526 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNQ2O43526 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNQ2O43526 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNQ2O43526 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNQ2O43526 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNQ2O43526 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNQ2O43526 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNQ2O43526 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNQ2O43526 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNQ2O43526 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNQ2O43526 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNQ2O43526 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNQ2O43526 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNQ2O43526 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNQ2O43526 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNQ2O43526 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNQ2O43526 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNQ2O43526 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNQ2O43526 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNQ2O43526 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNQ2O43526 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNQ2O43526 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNQ2O43526 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNQ2O43526 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNQ2O43526 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNQ2O43526 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNQ2O43526 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNQ2O43526 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNQ2O43526 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNQ2O43526 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNQ2O43526 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNQ2O43526 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNQ2O43526 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNQ2O43526 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNQ2O43526 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNQ2O43526 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNQ2O43526 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNQ2O43526 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNQ2O43526 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNQ2O43526 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNQ2O43526 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNQ2O43526 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNQ2O43526 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNQ2O43526 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNQ2O43526 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNQ2O43526 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNQ2O43526 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNQ2O43526 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNQ2O43526 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNQ2O43526 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNQ2O43526 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNQ2O43526 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNQ2O43526 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNQ2O43526 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNQ2O43526 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNQ2O43526 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNQ2O43526 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms