Protein–RNA interactions for Protein: O43255

SIAH2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIAH2O43255 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SIAH2O43255 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SIAH2O43255 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SIAH2O43255 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SIAH2O43255 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SIAH2O43255 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SIAH2O43255 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SIAH2O43255 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SIAH2O43255 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SIAH2O43255 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SIAH2O43255 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SIAH2O43255 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SIAH2O43255 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SIAH2O43255 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SIAH2O43255 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SIAH2O43255 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SIAH2O43255 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SIAH2O43255 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SIAH2O43255 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SIAH2O43255 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SIAH2O43255 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SIAH2O43255 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SIAH2O43255 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SIAH2O43255 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SIAH2O43255 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SIAH2O43255 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SIAH2O43255 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SIAH2O43255 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SIAH2O43255 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SIAH2O43255 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SIAH2O43255 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SIAH2O43255 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SIAH2O43255 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SIAH2O43255 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SIAH2O43255 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SIAH2O43255 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SIAH2O43255 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SIAH2O43255 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SIAH2O43255 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SIAH2O43255 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SIAH2O43255 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SIAH2O43255 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SIAH2O43255 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SIAH2O43255 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SIAH2O43255 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SIAH2O43255 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SIAH2O43255 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SIAH2O43255 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SIAH2O43255 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SIAH2O43255 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SIAH2O43255 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SIAH2O43255 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SIAH2O43255 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SIAH2O43255 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SIAH2O43255 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SIAH2O43255 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SIAH2O43255 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SIAH2O43255 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SIAH2O43255 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SIAH2O43255 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SIAH2O43255 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SIAH2O43255 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SIAH2O43255 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SIAH2O43255 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SIAH2O43255 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SIAH2O43255 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SIAH2O43255 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SIAH2O43255 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SIAH2O43255 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SIAH2O43255 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SIAH2O43255 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SIAH2O43255 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SIAH2O43255 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SIAH2O43255 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SIAH2O43255 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SIAH2O43255 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SIAH2O43255 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms