Protein–RNA interactions for Protein: O43147

SGSM2, Small G protein signaling modulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM2O43147 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms