Protein–RNA interactions for Protein: O14879

IFIT3, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIT3O14879 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms