Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRTO14522 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRTO14522 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRTO14522 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRTO14522 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRTO14522 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRTO14522 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRTO14522 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRTO14522 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRTO14522 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRTO14522 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRTO14522 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRTO14522 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRTO14522 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRTO14522 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRTO14522 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRTO14522 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRTO14522 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRTO14522 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPRTO14522 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPRTO14522 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPRTO14522 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPRTO14522 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPRTO14522 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPRTO14522 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPRTO14522 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPRTO14522 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPRTO14522 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPRTO14522 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPRTO14522 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPRTO14522 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPRTO14522 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPRTO14522 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPRTO14522 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPRTO14522 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPRTO14522 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPRTO14522 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPRTO14522 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPRTO14522 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPRTO14522 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPRTO14522 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPRTO14522 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPRTO14522 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPRTO14522 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPRTO14522 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPRTO14522 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPRTO14522 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPRTO14522 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPRTO14522 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPRTO14522 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPRTO14522 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPRTO14522 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPRTO14522 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPRTO14522 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPRTO14522 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPRTO14522 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPRTO14522 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPRTO14522 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPRTO14522 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPRTO14522 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPRTO14522 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPRTO14522 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPRTO14522 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPRTO14522 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPRTO14522 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPRTO14522 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPRTO14522 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPRTO14522 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPRTO14522 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPRTO14522 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPRTO14522 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPRTO14522 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPRTO14522 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPRTO14522 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPRTO14522 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPRTO14522 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPRTO14522 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPRTO14522 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPRTO14522 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPRTO14522 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPRTO14522 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPRTO14522 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PTPRTO14522 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PTPRTO14522 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PTPRTO14522 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PTPRTO14522 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PTPRTO14522 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PTPRTO14522 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PTPRTO14522 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTPRTO14522 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTPRTO14522 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTPRTO14522 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTPRTO14522 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTPRTO14522 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTPRTO14522 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
PTPRTO14522 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTPRTO14522 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPRTO14522 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPRTO14522 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPRTO14522 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
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