Protein–RNA interactions for Protein: O00370

LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
O00370 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
O00370 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
O00370 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
O00370 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
O00370 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
O00370 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
O00370 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
O00370 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
O00370 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
O00370 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
O00370 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
O00370 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
O00370 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
O00370 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
O00370 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
O00370 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
O00370 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
O00370 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
O00370 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
O00370 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
O00370 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
O00370 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
O00370 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
O00370 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
O00370 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
O00370 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
O00370 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
O00370 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
O00370 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
O00370 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
O00370 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
O00370 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
O00370 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
O00370 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
O00370 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
O00370 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
O00370 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
O00370 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
O00370 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
O00370 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
O00370 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
O00370 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
O00370 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
O00370 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
O00370 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
O00370 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
O00370 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
O00370 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
O00370 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
O00370 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
O00370 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
O00370 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
O00370 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
O00370 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
O00370 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
O00370 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
O00370 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
O00370 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
O00370 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
O00370 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
O00370 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
O00370 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
O00370 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
O00370 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
O00370 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
O00370 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
O00370 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
O00370 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
O00370 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
O00370 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
O00370 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
O00370 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
O00370 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
O00370 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
O00370 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
O00370 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
O00370 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
O00370 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
O00370 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
O00370 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
O00370 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
O00370 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
O00370 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
O00370 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
O00370 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
O00370 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
O00370 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
O00370 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
O00370 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
O00370 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
O00370 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
O00370 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
O00370 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
O00370 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
O00370 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
O00370 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
O00370 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
O00370 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
O00370 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
O00370 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms