Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms