Protein–RNA interactions for Protein: A6NHT5

HMX3, Homeobox protein HMX3, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX3A6NHT5 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMX3A6NHT5 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMX3A6NHT5 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMX3A6NHT5 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMX3A6NHT5 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMX3A6NHT5 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMX3A6NHT5 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMX3A6NHT5 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMX3A6NHT5 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMX3A6NHT5 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMX3A6NHT5 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMX3A6NHT5 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMX3A6NHT5 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMX3A6NHT5 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMX3A6NHT5 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMX3A6NHT5 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMX3A6NHT5 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMX3A6NHT5 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMX3A6NHT5 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMX3A6NHT5 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HMX3A6NHT5 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HMX3A6NHT5 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HMX3A6NHT5 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HMX3A6NHT5 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HMX3A6NHT5 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms