Protein–RNA interactions for Protein: A4QMS7

C5orf49, Uncharacterized protein C5orf49, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf49A4QMS7 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms