Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC144AA2RUR9 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC144AA2RUR9 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC144AA2RUR9 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC144AA2RUR9 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC144AA2RUR9 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC144AA2RUR9 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC144AA2RUR9 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC144AA2RUR9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC144AA2RUR9 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC144AA2RUR9 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC144AA2RUR9 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC144AA2RUR9 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC144AA2RUR9 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC144AA2RUR9 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC144AA2RUR9 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC144AA2RUR9 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC144AA2RUR9 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC144AA2RUR9 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC144AA2RUR9 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC144AA2RUR9 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC144AA2RUR9 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC144AA2RUR9 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC144AA2RUR9 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC144AA2RUR9 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC144AA2RUR9 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC144AA2RUR9 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC144AA2RUR9 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC144AA2RUR9 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC144AA2RUR9 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC144AA2RUR9 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC144AA2RUR9 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC144AA2RUR9 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC144AA2RUR9 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC144AA2RUR9 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC144AA2RUR9 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC144AA2RUR9 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC144AA2RUR9 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC144AA2RUR9 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC144AA2RUR9 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC144AA2RUR9 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC144AA2RUR9 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC144AA2RUR9 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC144AA2RUR9 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC144AA2RUR9 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC144AA2RUR9 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC144AA2RUR9 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC144AA2RUR9 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC144AA2RUR9 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC144AA2RUR9 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC144AA2RUR9 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC144AA2RUR9 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC144AA2RUR9 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC144AA2RUR9 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC144AA2RUR9 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC144AA2RUR9 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC144AA2RUR9 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC144AA2RUR9 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC144AA2RUR9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC144AA2RUR9 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC144AA2RUR9 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC144AA2RUR9 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC144AA2RUR9 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC144AA2RUR9 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC144AA2RUR9 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC144AA2RUR9 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC144AA2RUR9 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC144AA2RUR9 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC144AA2RUR9 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC144AA2RUR9 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC144AA2RUR9 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC144AA2RUR9 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC144AA2RUR9 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC144AA2RUR9 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC144AA2RUR9 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC144AA2RUR9 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC144AA2RUR9 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC144AA2RUR9 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC144AA2RUR9 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC144AA2RUR9 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC144AA2RUR9 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC144AA2RUR9 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC144AA2RUR9 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC144AA2RUR9 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC144AA2RUR9 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC144AA2RUR9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC144AA2RUR9 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC144AA2RUR9 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC144AA2RUR9 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC144AA2RUR9 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC144AA2RUR9 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC144AA2RUR9 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC144AA2RUR9 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC144AA2RUR9 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC144AA2RUR9 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC144AA2RUR9 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC144AA2RUR9 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC144AA2RUR9 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC144AA2RUR9 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC144AA2RUR9 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms