Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms