Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD8

RBM42, RNA-binding protein 42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM42Q9BTD8 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
RBM42Q9BTD8 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
RBM42Q9BTD8 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
RBM42Q9BTD8 uc_338.32-201ENST00000615087 172 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
RBM42Q9BTD8 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
RBM42Q9BTD8 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
RBM42Q9BTD8 RNU6-1250P-201ENST00000391218 107 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RBM42Q9BTD8 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RBM42Q9BTD8 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
RBM42Q9BTD8 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RBM42Q9BTD8 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RBM42Q9BTD8 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RBM42Q9BTD8 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
RBM42Q9BTD8 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
RBM42Q9BTD8 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
RBM42Q9BTD8 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
RBM42Q9BTD8 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
RBM42Q9BTD8 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
RBM42Q9BTD8 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
RBM42Q9BTD8 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
RBM42Q9BTD8 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
RBM42Q9BTD8 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
RBM42Q9BTD8 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RBM42Q9BTD8 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
RBM42Q9BTD8 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RBM42Q9BTD8 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RBM42Q9BTD8 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RBM42Q9BTD8 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RBM42Q9BTD8 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
RBM42Q9BTD8 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RBM42Q9BTD8 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
RBM42Q9BTD8 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
RBM42Q9BTD8 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
RBM42Q9BTD8 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
RBM42Q9BTD8 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
RBM42Q9BTD8 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
RBM42Q9BTD8 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
RBM42Q9BTD8 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
RBM42Q9BTD8 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
RBM42Q9BTD8 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
RBM42Q9BTD8 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
RBM42Q9BTD8 NLGN1-201ENST00000361589 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
RBM42Q9BTD8 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
RBM42Q9BTD8 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
RBM42Q9BTD8 MIR3074-201ENST00000384885 81 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
RBM42Q9BTD8 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
RBM42Q9BTD8 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
RBM42Q9BTD8 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
RBM42Q9BTD8 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
RBM42Q9BTD8 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
RBM42Q9BTD8 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RBM42Q9BTD8 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RBM42Q9BTD8 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RBM42Q9BTD8 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RBM42Q9BTD8 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RBM42Q9BTD8 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RBM42Q9BTD8 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
RBM42Q9BTD8 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
RBM42Q9BTD8 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
RBM42Q9BTD8 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
RBM42Q9BTD8 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
RBM42Q9BTD8 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
RBM42Q9BTD8 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
RBM42Q9BTD8 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RBM42Q9BTD8 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RBM42Q9BTD8 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RBM42Q9BTD8 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RBM42Q9BTD8 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RBM42Q9BTD8 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RBM42Q9BTD8 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RBM42Q9BTD8 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
RBM42Q9BTD8 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
RBM42Q9BTD8 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
RBM42Q9BTD8 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
RBM42Q9BTD8 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
RBM42Q9BTD8 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
RBM42Q9BTD8 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
RBM42Q9BTD8 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
RBM42Q9BTD8 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
RBM42Q9BTD8 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.77
RBM42Q9BTD8 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
RBM42Q9BTD8 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
RBM42Q9BTD8 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
RBM42Q9BTD8 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
RBM42Q9BTD8 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
RBM42Q9BTD8 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
RBM42Q9BTD8 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
RBM42Q9BTD8 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
RBM42Q9BTD8 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
RBM42Q9BTD8 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
RBM42Q9BTD8 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
RBM42Q9BTD8 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
RBM42Q9BTD8 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
RBM42Q9BTD8 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
RBM42Q9BTD8 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
RBM42Q9BTD8 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
RBM42Q9BTD8 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
RBM42Q9BTD8 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
RBM42Q9BTD8 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
RBM42Q9BTD8 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
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