Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD8

RBM42, RNA-binding protein 42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM42Q9BTD8 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
RBM42Q9BTD8 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
RBM42Q9BTD8 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
RBM42Q9BTD8 uc_338.32-201ENST00000615087 172 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
RBM42Q9BTD8 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
RBM42Q9BTD8 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
RBM42Q9BTD8 RNU6-1250P-201ENST00000391218 107 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RBM42Q9BTD8 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RBM42Q9BTD8 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
RBM42Q9BTD8 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RBM42Q9BTD8 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RBM42Q9BTD8 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RBM42Q9BTD8 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
RBM42Q9BTD8 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
RBM42Q9BTD8 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
RBM42Q9BTD8 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
RBM42Q9BTD8 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
RBM42Q9BTD8 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
RBM42Q9BTD8 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
RBM42Q9BTD8 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
RBM42Q9BTD8 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
RBM42Q9BTD8 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
RBM42Q9BTD8 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RBM42Q9BTD8 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
RBM42Q9BTD8 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RBM42Q9BTD8 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RBM42Q9BTD8 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RBM42Q9BTD8 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RBM42Q9BTD8 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
RBM42Q9BTD8 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RBM42Q9BTD8 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
RBM42Q9BTD8 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
RBM42Q9BTD8 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
RBM42Q9BTD8 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
RBM42Q9BTD8 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
RBM42Q9BTD8 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
RBM42Q9BTD8 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
RBM42Q9BTD8 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
RBM42Q9BTD8 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
RBM42Q9BTD8 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
RBM42Q9BTD8 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
RBM42Q9BTD8 NLGN1-201ENST00000361589 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
RBM42Q9BTD8 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
RBM42Q9BTD8 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
RBM42Q9BTD8 MIR3074-201ENST00000384885 81 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
RBM42Q9BTD8 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
RBM42Q9BTD8 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
RBM42Q9BTD8 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
RBM42Q9BTD8 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
RBM42Q9BTD8 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
RBM42Q9BTD8 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RBM42Q9BTD8 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RBM42Q9BTD8 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RBM42Q9BTD8 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RBM42Q9BTD8 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RBM42Q9BTD8 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RBM42Q9BTD8 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
RBM42Q9BTD8 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
RBM42Q9BTD8 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
RBM42Q9BTD8 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
RBM42Q9BTD8 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
RBM42Q9BTD8 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
RBM42Q9BTD8 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
RBM42Q9BTD8 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RBM42Q9BTD8 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RBM42Q9BTD8 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RBM42Q9BTD8 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RBM42Q9BTD8 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RBM42Q9BTD8 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RBM42Q9BTD8 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RBM42Q9BTD8 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
RBM42Q9BTD8 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
RBM42Q9BTD8 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
RBM42Q9BTD8 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
RBM42Q9BTD8 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
RBM42Q9BTD8 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
RBM42Q9BTD8 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
RBM42Q9BTD8 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
RBM42Q9BTD8 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
RBM42Q9BTD8 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.77
RBM42Q9BTD8 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
RBM42Q9BTD8 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
RBM42Q9BTD8 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
RBM42Q9BTD8 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
RBM42Q9BTD8 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
RBM42Q9BTD8 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
RBM42Q9BTD8 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
RBM42Q9BTD8 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
RBM42Q9BTD8 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
RBM42Q9BTD8 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
RBM42Q9BTD8 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
RBM42Q9BTD8 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
RBM42Q9BTD8 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
RBM42Q9BTD8 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
RBM42Q9BTD8 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
RBM42Q9BTD8 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
RBM42Q9BTD8 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
RBM42Q9BTD8 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
RBM42Q9BTD8 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
RBM42Q9BTD8 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
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