Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXD1Q16676 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXD1Q16676 CACNB4-257ENST00000637547 7658 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXD1Q16676 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXD1Q16676 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXD1Q16676 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXD1Q16676 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXD1Q16676 AC023669.2-201ENST00000436266 239 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXD1Q16676 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXD1Q16676 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXD1Q16676 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXD1Q16676 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXD1Q16676 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXD1Q16676 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXD1Q16676 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXD1Q16676 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXD1Q16676 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXD1Q16676 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXD1Q16676 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXD1Q16676 AC025445.1-201ENST00000502728 300 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXD1Q16676 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXD1Q16676 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXD1Q16676 SCAI-201ENST00000336505 12079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXD1Q16676 SLITRK4-203ENST00000596188 8545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXD1Q16676 F8-202ENST00000360256 9059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXD1Q16676 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXD1Q16676 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXD1Q16676 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
FOXD1Q16676 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXD1Q16676 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXD1Q16676 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXD1Q16676 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXD1Q16676 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXD1Q16676 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXD1Q16676 MEI4-201ENST00000602452 4800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXD1Q16676 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXD1Q16676 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXD1Q16676 MIR3074-201ENST00000384885 81 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXD1Q16676 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXD1Q16676 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXD1Q16676 CDH8-205ENST00000577730 8009 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXD1Q16676 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXD1Q16676 BTAF1-204ENST00000544642 6938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXD1Q16676 RNU6-419P-201ENST00000517030 63 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXD1Q16676 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXD1Q16676 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXD1Q16676 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXD1Q16676 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXD1Q16676 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXD1Q16676 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXD1Q16676 AC004552.1-201ENST00000419089 348 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXD1Q16676 RPS26P3-201ENST00000470205 348 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXD1Q16676 AC090543.2-201ENST00000483963 348 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXD1Q16676 AC004057.1-201ENST00000485827 348 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXD1Q16676 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXD1Q16676 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXD1Q16676 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXD1Q16676 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXD1Q16676 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXD1Q16676 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXD1Q16676 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXD1Q16676 MIR448-201ENST00000362131 111 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXD1Q16676 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXD1Q16676 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXD1Q16676 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXD1Q16676 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXD1Q16676 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXD1Q16676 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXD1Q16676 DDX60L-209ENST00000511577 6781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXD1Q16676 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXD1Q16676 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXD1Q16676 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXD1Q16676 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXD1Q16676 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXD1Q16676 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
FOXD1Q16676 ARID2-205ENST00000444670 7316 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
FOXD1Q16676 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXD1Q16676 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXD1Q16676 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXD1Q16676 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXD1Q16676 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXD1Q16676 WNK3-202ENST00000375159 5403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXD1Q16676 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXD1Q16676 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXD1Q16676 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXD1Q16676 MIR548AL-201ENST00000578416 97 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXD1Q16676 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXD1Q16676 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXD1Q16676 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXD1Q16676 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXD1Q16676 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXD1Q16676 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXD1Q16676 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXD1Q16676 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXD1Q16676 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXD1Q16676 FAT3-204ENST00000525166 18699 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXD1Q16676 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXD1Q16676 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXD1Q16676 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXD1Q16676 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
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