Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR8D1-203ENST00000641897 8285 ntAPPRIS P1 BASIC1.65□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01733-201ENST00000449316 4604 ntTSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 CYP4A43P-201ENST00000568156 121 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 THEMIS-202ENST00000368250 4101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATP8B4-201ENST00000284509 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-822P-201ENST00000362707 106 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-1204P-201ENST00000363948 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 HLA-N-201ENST00000437516 135 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL591424.2-201ENST00000617023 128 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR7154-201ENST00000620673 73 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 STON1-GTF2A1L-201ENST00000394751 3534 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC024940.1-203ENST00000398963 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC1.62□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 HDGFP1-201ENST00000405943 252 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 ERMN-201ENST00000397283 3760 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF28-203ENST00000438150 5171 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
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