Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SH3BP1Q9Y3L3 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
SH3BP1Q9Y3L3 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SH3BP1Q9Y3L3 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SH3BP1Q9Y3L3 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SH3BP1Q9Y3L3 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SH3BP1Q9Y3L3 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SH3BP1Q9Y3L3 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SH3BP1Q9Y3L3 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SH3BP1Q9Y3L3 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SH3BP1Q9Y3L3 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SH3BP1Q9Y3L3 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
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SH3BP1Q9Y3L3 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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SH3BP1Q9Y3L3 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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SH3BP1Q9Y3L3 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
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SH3BP1Q9Y3L3 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
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SH3BP1Q9Y3L3 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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SH3BP1Q9Y3L3 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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SH3BP1Q9Y3L3 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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SH3BP1Q9Y3L3 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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SH3BP1Q9Y3L3 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
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