Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMED7Q9Y3B3 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMED7Q9Y3B3 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMED7Q9Y3B3 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TMED7Q9Y3B3 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMED7Q9Y3B3 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMED7Q9Y3B3 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMED7Q9Y3B3 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TMED7Q9Y3B3 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TMED7Q9Y3B3 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMED7Q9Y3B3 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMED7Q9Y3B3 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMED7Q9Y3B3 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TMED7Q9Y3B3 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMED7Q9Y3B3 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMED7Q9Y3B3 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMED7Q9Y3B3 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMED7Q9Y3B3 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMED7Q9Y3B3 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMED7Q9Y3B3 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMED7Q9Y3B3 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMED7Q9Y3B3 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMED7Q9Y3B3 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMED7Q9Y3B3 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMED7Q9Y3B3 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMED7Q9Y3B3 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMED7Q9Y3B3 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMED7Q9Y3B3 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMED7Q9Y3B3 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMED7Q9Y3B3 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMED7Q9Y3B3 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TMED7Q9Y3B3 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMED7Q9Y3B3 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMED7Q9Y3B3 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TMED7Q9Y3B3 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMED7Q9Y3B3 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMED7Q9Y3B3 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMED7Q9Y3B3 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMED7Q9Y3B3 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMED7Q9Y3B3 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMED7Q9Y3B3 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMED7Q9Y3B3 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMED7Q9Y3B3 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMED7Q9Y3B3 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMED7Q9Y3B3 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMED7Q9Y3B3 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMED7Q9Y3B3 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMED7Q9Y3B3 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMED7Q9Y3B3 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
TMED7Q9Y3B3 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMED7Q9Y3B3 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMED7Q9Y3B3 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMED7Q9Y3B3 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMED7Q9Y3B3 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TMED7Q9Y3B3 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMED7Q9Y3B3 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMED7Q9Y3B3 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMED7Q9Y3B3 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMED7Q9Y3B3 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMED7Q9Y3B3 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMED7Q9Y3B3 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TMED7Q9Y3B3 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMED7Q9Y3B3 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TMED7Q9Y3B3 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMED7Q9Y3B3 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMED7Q9Y3B3 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMED7Q9Y3B3 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TMED7Q9Y3B3 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMED7Q9Y3B3 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMED7Q9Y3B3 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMED7Q9Y3B3 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TMED7Q9Y3B3 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMED7Q9Y3B3 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMED7Q9Y3B3 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMED7Q9Y3B3 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMED7Q9Y3B3 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMED7Q9Y3B3 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMED7Q9Y3B3 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMED7Q9Y3B3 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMED7Q9Y3B3 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMED7Q9Y3B3 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMED7Q9Y3B3 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMED7Q9Y3B3 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMED7Q9Y3B3 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMED7Q9Y3B3 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMED7Q9Y3B3 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMED7Q9Y3B3 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMED7Q9Y3B3 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMED7Q9Y3B3 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMED7Q9Y3B3 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMED7Q9Y3B3 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TMED7Q9Y3B3 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMED7Q9Y3B3 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMED7Q9Y3B3 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMED7Q9Y3B3 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMED7Q9Y3B3 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMED7Q9Y3B3 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMED7Q9Y3B3 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMED7Q9Y3B3 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMED7Q9Y3B3 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms