Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2V7

COG6, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG6Q9Y2V7 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COG6Q9Y2V7 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COG6Q9Y2V7 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COG6Q9Y2V7 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COG6Q9Y2V7 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COG6Q9Y2V7 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COG6Q9Y2V7 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COG6Q9Y2V7 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COG6Q9Y2V7 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
COG6Q9Y2V7 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COG6Q9Y2V7 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COG6Q9Y2V7 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
COG6Q9Y2V7 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COG6Q9Y2V7 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COG6Q9Y2V7 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COG6Q9Y2V7 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COG6Q9Y2V7 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COG6Q9Y2V7 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COG6Q9Y2V7 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COG6Q9Y2V7 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COG6Q9Y2V7 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COG6Q9Y2V7 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COG6Q9Y2V7 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COG6Q9Y2V7 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COG6Q9Y2V7 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
COG6Q9Y2V7 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
COG6Q9Y2V7 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COG6Q9Y2V7 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COG6Q9Y2V7 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC24■■□□□ 1.43
COG6Q9Y2V7 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COG6Q9Y2V7 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COG6Q9Y2V7 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COG6Q9Y2V7 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COG6Q9Y2V7 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COG6Q9Y2V7 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC24■■□□□ 1.43
COG6Q9Y2V7 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
COG6Q9Y2V7 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
COG6Q9Y2V7 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC24■■□□□ 1.43
COG6Q9Y2V7 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COG6Q9Y2V7 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
COG6Q9Y2V7 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
COG6Q9Y2V7 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COG6Q9Y2V7 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COG6Q9Y2V7 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC24■■□□□ 1.43
COG6Q9Y2V7 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COG6Q9Y2V7 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COG6Q9Y2V7 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COG6Q9Y2V7 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COG6Q9Y2V7 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COG6Q9Y2V7 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COG6Q9Y2V7 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COG6Q9Y2V7 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COG6Q9Y2V7 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COG6Q9Y2V7 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COG6Q9Y2V7 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COG6Q9Y2V7 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COG6Q9Y2V7 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COG6Q9Y2V7 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms