Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G9

SBNO2, Protein strawberry notch homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO2Q9Y2G9 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SBNO2Q9Y2G9 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SBNO2Q9Y2G9 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SBNO2Q9Y2G9 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SBNO2Q9Y2G9 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SBNO2Q9Y2G9 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SBNO2Q9Y2G9 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SBNO2Q9Y2G9 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SBNO2Q9Y2G9 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SBNO2Q9Y2G9 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SBNO2Q9Y2G9 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SBNO2Q9Y2G9 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SBNO2Q9Y2G9 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SBNO2Q9Y2G9 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SBNO2Q9Y2G9 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SBNO2Q9Y2G9 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SBNO2Q9Y2G9 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SBNO2Q9Y2G9 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SBNO2Q9Y2G9 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SBNO2Q9Y2G9 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SBNO2Q9Y2G9 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SBNO2Q9Y2G9 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SBNO2Q9Y2G9 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SBNO2Q9Y2G9 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SBNO2Q9Y2G9 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SBNO2Q9Y2G9 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SBNO2Q9Y2G9 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SBNO2Q9Y2G9 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SBNO2Q9Y2G9 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SBNO2Q9Y2G9 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SBNO2Q9Y2G9 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SBNO2Q9Y2G9 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SBNO2Q9Y2G9 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SBNO2Q9Y2G9 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SBNO2Q9Y2G9 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SBNO2Q9Y2G9 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SBNO2Q9Y2G9 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SBNO2Q9Y2G9 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SBNO2Q9Y2G9 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SBNO2Q9Y2G9 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SBNO2Q9Y2G9 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SBNO2Q9Y2G9 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SBNO2Q9Y2G9 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SBNO2Q9Y2G9 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SBNO2Q9Y2G9 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SBNO2Q9Y2G9 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SBNO2Q9Y2G9 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SBNO2Q9Y2G9 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SBNO2Q9Y2G9 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SBNO2Q9Y2G9 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SBNO2Q9Y2G9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SBNO2Q9Y2G9 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SBNO2Q9Y2G9 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SBNO2Q9Y2G9 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SBNO2Q9Y2G9 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SBNO2Q9Y2G9 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SBNO2Q9Y2G9 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SBNO2Q9Y2G9 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SBNO2Q9Y2G9 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SBNO2Q9Y2G9 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SBNO2Q9Y2G9 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SBNO2Q9Y2G9 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SBNO2Q9Y2G9 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SBNO2Q9Y2G9 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SBNO2Q9Y2G9 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SBNO2Q9Y2G9 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SBNO2Q9Y2G9 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SBNO2Q9Y2G9 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SBNO2Q9Y2G9 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SBNO2Q9Y2G9 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SBNO2Q9Y2G9 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SBNO2Q9Y2G9 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SBNO2Q9Y2G9 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SBNO2Q9Y2G9 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SBNO2Q9Y2G9 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SBNO2Q9Y2G9 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SBNO2Q9Y2G9 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SBNO2Q9Y2G9 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
SBNO2Q9Y2G9 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SBNO2Q9Y2G9 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SBNO2Q9Y2G9 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SBNO2Q9Y2G9 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SBNO2Q9Y2G9 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SBNO2Q9Y2G9 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SBNO2Q9Y2G9 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SBNO2Q9Y2G9 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SBNO2Q9Y2G9 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SBNO2Q9Y2G9 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SBNO2Q9Y2G9 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SBNO2Q9Y2G9 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SBNO2Q9Y2G9 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SBNO2Q9Y2G9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SBNO2Q9Y2G9 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SBNO2Q9Y2G9 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SBNO2Q9Y2G9 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SBNO2Q9Y2G9 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SBNO2Q9Y2G9 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SBNO2Q9Y2G9 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SBNO2Q9Y2G9 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SBNO2Q9Y2G9 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms