Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y285

FARSA, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARSAQ9Y285 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms