Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TRAK1Q9UPV9 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
TRAK1Q9UPV9 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TRAK1Q9UPV9 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRAK1Q9UPV9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRAK1Q9UPV9 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRAK1Q9UPV9 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRAK1Q9UPV9 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRAK1Q9UPV9 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRAK1Q9UPV9 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRAK1Q9UPV9 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRAK1Q9UPV9 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRAK1Q9UPV9 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRAK1Q9UPV9 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRAK1Q9UPV9 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRAK1Q9UPV9 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRAK1Q9UPV9 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRAK1Q9UPV9 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRAK1Q9UPV9 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRAK1Q9UPV9 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRAK1Q9UPV9 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRAK1Q9UPV9 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRAK1Q9UPV9 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRAK1Q9UPV9 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRAK1Q9UPV9 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRAK1Q9UPV9 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRAK1Q9UPV9 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRAK1Q9UPV9 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRAK1Q9UPV9 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRAK1Q9UPV9 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms