Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
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USP18Q9UMW8 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
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USP18Q9UMW8 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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USP18Q9UMW8 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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USP18Q9UMW8 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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USP18Q9UMW8 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
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