Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULU4

ZMYND8, Protein kinase C-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZMYND8Q9ULU4 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZMYND8Q9ULU4 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZMYND8Q9ULU4 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms