Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
INO80Q9ULG1 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
INO80Q9ULG1 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
INO80Q9ULG1 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
INO80Q9ULG1 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
INO80Q9ULG1 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
INO80Q9ULG1 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
INO80Q9ULG1 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
INO80Q9ULG1 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
INO80Q9ULG1 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
INO80Q9ULG1 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
INO80Q9ULG1 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
INO80Q9ULG1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
INO80Q9ULG1 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
INO80Q9ULG1 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC28■■■□□ 2.07
INO80Q9ULG1 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
INO80Q9ULG1 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
INO80Q9ULG1 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
INO80Q9ULG1 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
INO80Q9ULG1 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
INO80Q9ULG1 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
INO80Q9ULG1 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
INO80Q9ULG1 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
INO80Q9ULG1 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
INO80Q9ULG1 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
INO80Q9ULG1 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
INO80Q9ULG1 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
INO80Q9ULG1 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
INO80Q9ULG1 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
INO80Q9ULG1 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
INO80Q9ULG1 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
INO80Q9ULG1 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
INO80Q9ULG1 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
INO80Q9ULG1 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
INO80Q9ULG1 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
INO80Q9ULG1 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
INO80Q9ULG1 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
INO80Q9ULG1 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
INO80Q9ULG1 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
INO80Q9ULG1 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
INO80Q9ULG1 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
INO80Q9ULG1 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
INO80Q9ULG1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
INO80Q9ULG1 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
INO80Q9ULG1 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
INO80Q9ULG1 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
INO80Q9ULG1 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
INO80Q9ULG1 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
INO80Q9ULG1 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
INO80Q9ULG1 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
INO80Q9ULG1 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
INO80Q9ULG1 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
INO80Q9ULG1 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
INO80Q9ULG1 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
INO80Q9ULG1 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
INO80Q9ULG1 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
INO80Q9ULG1 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
INO80Q9ULG1 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
INO80Q9ULG1 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
INO80Q9ULG1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
INO80Q9ULG1 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
INO80Q9ULG1 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
INO80Q9ULG1 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
INO80Q9ULG1 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
INO80Q9ULG1 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
INO80Q9ULG1 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
INO80Q9ULG1 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
INO80Q9ULG1 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
INO80Q9ULG1 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
INO80Q9ULG1 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
INO80Q9ULG1 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
INO80Q9ULG1 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
INO80Q9ULG1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
INO80Q9ULG1 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
INO80Q9ULG1 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
INO80Q9ULG1 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
INO80Q9ULG1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
INO80Q9ULG1 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
INO80Q9ULG1 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
INO80Q9ULG1 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
INO80Q9ULG1 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
INO80Q9ULG1 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
INO80Q9ULG1 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
INO80Q9ULG1 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
INO80Q9ULG1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
INO80Q9ULG1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
INO80Q9ULG1 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
INO80Q9ULG1 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
INO80Q9ULG1 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
INO80Q9ULG1 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
INO80Q9ULG1 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
INO80Q9ULG1 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
INO80Q9ULG1 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
INO80Q9ULG1 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
INO80Q9ULG1 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
INO80Q9ULG1 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
INO80Q9ULG1 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
INO80Q9ULG1 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
INO80Q9ULG1 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
INO80Q9ULG1 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms