Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL4

GJD2, Gap junction delta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD2Q9UKL4 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.8 ms