Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKK3

PARP4, Poly [ADP-ribose] polymerase 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP4Q9UKK3 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms