Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms