Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD9

UBQLN2, Ubiquilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN2Q9UHD9 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBQLN2Q9UHD9 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBQLN2Q9UHD9 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBQLN2Q9UHD9 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBQLN2Q9UHD9 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBQLN2Q9UHD9 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBQLN2Q9UHD9 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBQLN2Q9UHD9 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBQLN2Q9UHD9 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBQLN2Q9UHD9 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBQLN2Q9UHD9 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBQLN2Q9UHD9 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBQLN2Q9UHD9 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBQLN2Q9UHD9 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBQLN2Q9UHD9 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBQLN2Q9UHD9 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBQLN2Q9UHD9 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBQLN2Q9UHD9 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBQLN2Q9UHD9 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBQLN2Q9UHD9 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBQLN2Q9UHD9 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBQLN2Q9UHD9 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBQLN2Q9UHD9 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBQLN2Q9UHD9 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBQLN2Q9UHD9 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBQLN2Q9UHD9 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBQLN2Q9UHD9 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBQLN2Q9UHD9 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBQLN2Q9UHD9 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBQLN2Q9UHD9 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBQLN2Q9UHD9 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBQLN2Q9UHD9 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBQLN2Q9UHD9 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBQLN2Q9UHD9 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBQLN2Q9UHD9 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBQLN2Q9UHD9 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBQLN2Q9UHD9 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBQLN2Q9UHD9 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBQLN2Q9UHD9 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBQLN2Q9UHD9 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBQLN2Q9UHD9 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBQLN2Q9UHD9 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBQLN2Q9UHD9 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBQLN2Q9UHD9 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
UBQLN2Q9UHD9 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBQLN2Q9UHD9 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBQLN2Q9UHD9 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBQLN2Q9UHD9 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBQLN2Q9UHD9 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBQLN2Q9UHD9 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBQLN2Q9UHD9 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBQLN2Q9UHD9 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
UBQLN2Q9UHD9 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBQLN2Q9UHD9 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBQLN2Q9UHD9 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBQLN2Q9UHD9 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBQLN2Q9UHD9 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBQLN2Q9UHD9 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBQLN2Q9UHD9 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBQLN2Q9UHD9 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBQLN2Q9UHD9 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
UBQLN2Q9UHD9 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBQLN2Q9UHD9 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBQLN2Q9UHD9 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBQLN2Q9UHD9 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBQLN2Q9UHD9 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBQLN2Q9UHD9 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBQLN2Q9UHD9 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBQLN2Q9UHD9 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBQLN2Q9UHD9 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBQLN2Q9UHD9 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBQLN2Q9UHD9 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBQLN2Q9UHD9 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBQLN2Q9UHD9 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBQLN2Q9UHD9 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBQLN2Q9UHD9 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBQLN2Q9UHD9 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBQLN2Q9UHD9 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBQLN2Q9UHD9 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBQLN2Q9UHD9 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBQLN2Q9UHD9 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBQLN2Q9UHD9 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBQLN2Q9UHD9 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBQLN2Q9UHD9 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBQLN2Q9UHD9 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBQLN2Q9UHD9 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBQLN2Q9UHD9 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBQLN2Q9UHD9 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBQLN2Q9UHD9 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBQLN2Q9UHD9 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBQLN2Q9UHD9 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBQLN2Q9UHD9 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBQLN2Q9UHD9 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBQLN2Q9UHD9 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBQLN2Q9UHD9 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBQLN2Q9UHD9 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBQLN2Q9UHD9 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
UBQLN2Q9UHD9 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBQLN2Q9UHD9 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBQLN2Q9UHD9 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms