Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
NKX1-2Q9UD57 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
NKX1-2Q9UD57 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
NKX1-2Q9UD57 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NKX1-2Q9UD57 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NKX1-2Q9UD57 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NKX1-2Q9UD57 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NKX1-2Q9UD57 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NKX1-2Q9UD57 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NKX1-2Q9UD57 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NKX1-2Q9UD57 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NKX1-2Q9UD57 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NKX1-2Q9UD57 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NKX1-2Q9UD57 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NKX1-2Q9UD57 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NKX1-2Q9UD57 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NKX1-2Q9UD57 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms