Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
HDAC6Q9UBN7 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HDAC6Q9UBN7 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HDAC6Q9UBN7 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
HDAC6Q9UBN7 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HDAC6Q9UBN7 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
HDAC6Q9UBN7 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HDAC6Q9UBN7 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
HDAC6Q9UBN7 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HDAC6Q9UBN7 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HDAC6Q9UBN7 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HDAC6Q9UBN7 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HDAC6Q9UBN7 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HDAC6Q9UBN7 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HDAC6Q9UBN7 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HDAC6Q9UBN7 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HDAC6Q9UBN7 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HDAC6Q9UBN7 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HDAC6Q9UBN7 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HDAC6Q9UBN7 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HDAC6Q9UBN7 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HDAC6Q9UBN7 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
HDAC6Q9UBN7 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HDAC6Q9UBN7 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HDAC6Q9UBN7 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HDAC6Q9UBN7 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HDAC6Q9UBN7 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HDAC6Q9UBN7 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
HDAC6Q9UBN7 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
HDAC6Q9UBN7 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HDAC6Q9UBN7 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HDAC6Q9UBN7 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HDAC6Q9UBN7 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HDAC6Q9UBN7 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HDAC6Q9UBN7 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HDAC6Q9UBN7 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HDAC6Q9UBN7 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HDAC6Q9UBN7 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HDAC6Q9UBN7 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HDAC6Q9UBN7 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HDAC6Q9UBN7 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HDAC6Q9UBN7 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HDAC6Q9UBN7 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HDAC6Q9UBN7 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HDAC6Q9UBN7 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HDAC6Q9UBN7 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HDAC6Q9UBN7 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HDAC6Q9UBN7 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HDAC6Q9UBN7 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HDAC6Q9UBN7 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HDAC6Q9UBN7 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HDAC6Q9UBN7 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HDAC6Q9UBN7 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HDAC6Q9UBN7 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HDAC6Q9UBN7 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HDAC6Q9UBN7 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HDAC6Q9UBN7 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HDAC6Q9UBN7 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HDAC6Q9UBN7 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HDAC6Q9UBN7 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HDAC6Q9UBN7 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HDAC6Q9UBN7 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HDAC6Q9UBN7 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HDAC6Q9UBN7 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HDAC6Q9UBN7 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HDAC6Q9UBN7 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HDAC6Q9UBN7 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HDAC6Q9UBN7 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HDAC6Q9UBN7 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HDAC6Q9UBN7 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HDAC6Q9UBN7 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HDAC6Q9UBN7 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HDAC6Q9UBN7 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HDAC6Q9UBN7 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HDAC6Q9UBN7 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HDAC6Q9UBN7 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HDAC6Q9UBN7 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HDAC6Q9UBN7 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HDAC6Q9UBN7 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HDAC6Q9UBN7 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HDAC6Q9UBN7 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HDAC6Q9UBN7 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
HDAC6Q9UBN7 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HDAC6Q9UBN7 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HDAC6Q9UBN7 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HDAC6Q9UBN7 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HDAC6Q9UBN7 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HDAC6Q9UBN7 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
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