Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2B4

CTTNBP2NL, CTTNBP2 N-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTTNBP2NLQ9P2B4 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTTNBP2NLQ9P2B4 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTTNBP2NLQ9P2B4 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTTNBP2NLQ9P2B4 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTTNBP2NLQ9P2B4 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTTNBP2NLQ9P2B4 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTTNBP2NLQ9P2B4 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTTNBP2NLQ9P2B4 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTTNBP2NLQ9P2B4 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTTNBP2NLQ9P2B4 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTTNBP2NLQ9P2B4 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTTNBP2NLQ9P2B4 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTTNBP2NLQ9P2B4 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTTNBP2NLQ9P2B4 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTTNBP2NLQ9P2B4 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTTNBP2NLQ9P2B4 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTTNBP2NLQ9P2B4 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTTNBP2NLQ9P2B4 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTTNBP2NLQ9P2B4 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTTNBP2NLQ9P2B4 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTTNBP2NLQ9P2B4 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTTNBP2NLQ9P2B4 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTTNBP2NLQ9P2B4 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTTNBP2NLQ9P2B4 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTTNBP2NLQ9P2B4 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTTNBP2NLQ9P2B4 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTTNBP2NLQ9P2B4 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTTNBP2NLQ9P2B4 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTTNBP2NLQ9P2B4 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTTNBP2NLQ9P2B4 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTTNBP2NLQ9P2B4 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTTNBP2NLQ9P2B4 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTTNBP2NLQ9P2B4 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTTNBP2NLQ9P2B4 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTTNBP2NLQ9P2B4 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTTNBP2NLQ9P2B4 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTTNBP2NLQ9P2B4 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTTNBP2NLQ9P2B4 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTTNBP2NLQ9P2B4 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTTNBP2NLQ9P2B4 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTTNBP2NLQ9P2B4 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTTNBP2NLQ9P2B4 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTTNBP2NLQ9P2B4 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTTNBP2NLQ9P2B4 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTTNBP2NLQ9P2B4 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTTNBP2NLQ9P2B4 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTTNBP2NLQ9P2B4 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTTNBP2NLQ9P2B4 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTTNBP2NLQ9P2B4 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTTNBP2NLQ9P2B4 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTTNBP2NLQ9P2B4 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTTNBP2NLQ9P2B4 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTTNBP2NLQ9P2B4 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CTTNBP2NLQ9P2B4 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTTNBP2NLQ9P2B4 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTTNBP2NLQ9P2B4 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTTNBP2NLQ9P2B4 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTTNBP2NLQ9P2B4 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTTNBP2NLQ9P2B4 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTTNBP2NLQ9P2B4 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTTNBP2NLQ9P2B4 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTTNBP2NLQ9P2B4 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTTNBP2NLQ9P2B4 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTTNBP2NLQ9P2B4 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTTNBP2NLQ9P2B4 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTTNBP2NLQ9P2B4 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTTNBP2NLQ9P2B4 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTTNBP2NLQ9P2B4 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTTNBP2NLQ9P2B4 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTTNBP2NLQ9P2B4 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTTNBP2NLQ9P2B4 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTTNBP2NLQ9P2B4 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTTNBP2NLQ9P2B4 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTTNBP2NLQ9P2B4 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTTNBP2NLQ9P2B4 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTTNBP2NLQ9P2B4 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTTNBP2NLQ9P2B4 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTTNBP2NLQ9P2B4 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTTNBP2NLQ9P2B4 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTTNBP2NLQ9P2B4 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTTNBP2NLQ9P2B4 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTTNBP2NLQ9P2B4 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTTNBP2NLQ9P2B4 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTTNBP2NLQ9P2B4 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTTNBP2NLQ9P2B4 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTTNBP2NLQ9P2B4 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTTNBP2NLQ9P2B4 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTTNBP2NLQ9P2B4 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTTNBP2NLQ9P2B4 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms