Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYZ1

TVP23B, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23BQ9NYZ1 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms