Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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