Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMOD3Q9NYL9 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMOD3Q9NYL9 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMOD3Q9NYL9 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMOD3Q9NYL9 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMOD3Q9NYL9 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms