Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD9

DUOX1, Dual oxidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX1Q9NRD9 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC23■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC23■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC23■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC23■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms