Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS7

INCENP, Inner centromere protein, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INCENPQ9NQS7 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms