Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms