Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPP4

NLRC4, NLR family CARD domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC4Q9NPP4 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NLRC4Q9NPP4 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NLRC4Q9NPP4 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NLRC4Q9NPP4 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NLRC4Q9NPP4 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NLRC4Q9NPP4 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NLRC4Q9NPP4 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NLRC4Q9NPP4 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NLRC4Q9NPP4 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NLRC4Q9NPP4 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NLRC4Q9NPP4 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NLRC4Q9NPP4 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NLRC4Q9NPP4 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NLRC4Q9NPP4 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NLRC4Q9NPP4 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NLRC4Q9NPP4 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NLRC4Q9NPP4 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NLRC4Q9NPP4 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NLRC4Q9NPP4 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NLRC4Q9NPP4 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NLRC4Q9NPP4 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NLRC4Q9NPP4 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NLRC4Q9NPP4 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NLRC4Q9NPP4 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NLRC4Q9NPP4 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NLRC4Q9NPP4 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NLRC4Q9NPP4 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NLRC4Q9NPP4 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NLRC4Q9NPP4 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NLRC4Q9NPP4 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NLRC4Q9NPP4 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NLRC4Q9NPP4 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NLRC4Q9NPP4 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NLRC4Q9NPP4 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NLRC4Q9NPP4 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NLRC4Q9NPP4 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NLRC4Q9NPP4 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NLRC4Q9NPP4 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NLRC4Q9NPP4 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NLRC4Q9NPP4 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NLRC4Q9NPP4 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NLRC4Q9NPP4 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NLRC4Q9NPP4 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NLRC4Q9NPP4 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NLRC4Q9NPP4 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NLRC4Q9NPP4 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NLRC4Q9NPP4 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NLRC4Q9NPP4 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NLRC4Q9NPP4 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NLRC4Q9NPP4 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NLRC4Q9NPP4 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NLRC4Q9NPP4 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NLRC4Q9NPP4 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NLRC4Q9NPP4 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NLRC4Q9NPP4 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NLRC4Q9NPP4 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NLRC4Q9NPP4 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NLRC4Q9NPP4 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NLRC4Q9NPP4 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NLRC4Q9NPP4 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NLRC4Q9NPP4 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NLRC4Q9NPP4 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NLRC4Q9NPP4 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NLRC4Q9NPP4 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NLRC4Q9NPP4 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NLRC4Q9NPP4 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NLRC4Q9NPP4 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NLRC4Q9NPP4 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NLRC4Q9NPP4 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NLRC4Q9NPP4 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NLRC4Q9NPP4 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NLRC4Q9NPP4 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NLRC4Q9NPP4 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NLRC4Q9NPP4 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NLRC4Q9NPP4 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NLRC4Q9NPP4 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NLRC4Q9NPP4 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NLRC4Q9NPP4 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NLRC4Q9NPP4 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NLRC4Q9NPP4 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NLRC4Q9NPP4 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NLRC4Q9NPP4 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NLRC4Q9NPP4 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NLRC4Q9NPP4 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NLRC4Q9NPP4 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NLRC4Q9NPP4 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NLRC4Q9NPP4 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NLRC4Q9NPP4 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NLRC4Q9NPP4 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NLRC4Q9NPP4 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NLRC4Q9NPP4 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NLRC4Q9NPP4 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NLRC4Q9NPP4 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NLRC4Q9NPP4 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NLRC4Q9NPP4 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NLRC4Q9NPP4 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NLRC4Q9NPP4 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NLRC4Q9NPP4 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NLRC4Q9NPP4 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NLRC4Q9NPP4 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms