Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNZ6

PRM3, Protamine-3, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRM3Q9NNZ6 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PRM3Q9NNZ6 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PRM3Q9NNZ6 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PRM3Q9NNZ6 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PRM3Q9NNZ6 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PRM3Q9NNZ6 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PRM3Q9NNZ6 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PRM3Q9NNZ6 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PRM3Q9NNZ6 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PRM3Q9NNZ6 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PRM3Q9NNZ6 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PRM3Q9NNZ6 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PRM3Q9NNZ6 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PRM3Q9NNZ6 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PRM3Q9NNZ6 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PRM3Q9NNZ6 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PRM3Q9NNZ6 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRM3Q9NNZ6 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRM3Q9NNZ6 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRM3Q9NNZ6 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRM3Q9NNZ6 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRM3Q9NNZ6 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRM3Q9NNZ6 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRM3Q9NNZ6 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRM3Q9NNZ6 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRM3Q9NNZ6 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRM3Q9NNZ6 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRM3Q9NNZ6 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRM3Q9NNZ6 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRM3Q9NNZ6 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRM3Q9NNZ6 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PRM3Q9NNZ6 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PRM3Q9NNZ6 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRM3Q9NNZ6 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRM3Q9NNZ6 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRM3Q9NNZ6 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRM3Q9NNZ6 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRM3Q9NNZ6 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRM3Q9NNZ6 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRM3Q9NNZ6 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRM3Q9NNZ6 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRM3Q9NNZ6 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRM3Q9NNZ6 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRM3Q9NNZ6 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRM3Q9NNZ6 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRM3Q9NNZ6 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRM3Q9NNZ6 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRM3Q9NNZ6 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRM3Q9NNZ6 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRM3Q9NNZ6 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRM3Q9NNZ6 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRM3Q9NNZ6 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRM3Q9NNZ6 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRM3Q9NNZ6 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRM3Q9NNZ6 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRM3Q9NNZ6 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRM3Q9NNZ6 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRM3Q9NNZ6 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRM3Q9NNZ6 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRM3Q9NNZ6 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRM3Q9NNZ6 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRM3Q9NNZ6 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRM3Q9NNZ6 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRM3Q9NNZ6 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRM3Q9NNZ6 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRM3Q9NNZ6 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRM3Q9NNZ6 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRM3Q9NNZ6 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRM3Q9NNZ6 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRM3Q9NNZ6 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRM3Q9NNZ6 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRM3Q9NNZ6 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRM3Q9NNZ6 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRM3Q9NNZ6 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRM3Q9NNZ6 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRM3Q9NNZ6 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRM3Q9NNZ6 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRM3Q9NNZ6 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRM3Q9NNZ6 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRM3Q9NNZ6 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRM3Q9NNZ6 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PRM3Q9NNZ6 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRM3Q9NNZ6 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRM3Q9NNZ6 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRM3Q9NNZ6 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRM3Q9NNZ6 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PRM3Q9NNZ6 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRM3Q9NNZ6 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRM3Q9NNZ6 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRM3Q9NNZ6 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PRM3Q9NNZ6 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PRM3Q9NNZ6 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRM3Q9NNZ6 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRM3Q9NNZ6 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRM3Q9NNZ6 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRM3Q9NNZ6 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRM3Q9NNZ6 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRM3Q9NNZ6 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRM3Q9NNZ6 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRM3Q9NNZ6 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms