Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KIAA1549Q9HCM3 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KIAA1549Q9HCM3 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KIAA1549Q9HCM3 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
KIAA1549Q9HCM3 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KIAA1549Q9HCM3 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KIAA1549Q9HCM3 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KIAA1549Q9HCM3 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KIAA1549Q9HCM3 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KIAA1549Q9HCM3 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KIAA1549Q9HCM3 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KIAA1549Q9HCM3 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
KIAA1549Q9HCM3 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KIAA1549Q9HCM3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KIAA1549Q9HCM3 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KIAA1549Q9HCM3 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KIAA1549Q9HCM3 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KIAA1549Q9HCM3 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KIAA1549Q9HCM3 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KIAA1549Q9HCM3 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KIAA1549Q9HCM3 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KIAA1549Q9HCM3 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KIAA1549Q9HCM3 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KIAA1549Q9HCM3 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KIAA1549Q9HCM3 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KIAA1549Q9HCM3 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KIAA1549Q9HCM3 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KIAA1549Q9HCM3 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KIAA1549Q9HCM3 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KIAA1549Q9HCM3 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KIAA1549Q9HCM3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
KIAA1549Q9HCM3 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
KIAA1549Q9HCM3 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
KIAA1549Q9HCM3 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
KIAA1549Q9HCM3 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
KIAA1549Q9HCM3 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
KIAA1549Q9HCM3 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
KIAA1549Q9HCM3 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KIAA1549Q9HCM3 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms