Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CLSPNQ9HAW4 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CLSPNQ9HAW4 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CLSPNQ9HAW4 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CLSPNQ9HAW4 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CLSPNQ9HAW4 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CLSPNQ9HAW4 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CLSPNQ9HAW4 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CLSPNQ9HAW4 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CLSPNQ9HAW4 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CLSPNQ9HAW4 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CLSPNQ9HAW4 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CLSPNQ9HAW4 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CLSPNQ9HAW4 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CLSPNQ9HAW4 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CLSPNQ9HAW4 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CLSPNQ9HAW4 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CLSPNQ9HAW4 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CLSPNQ9HAW4 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CLSPNQ9HAW4 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CLSPNQ9HAW4 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CLSPNQ9HAW4 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
CLSPNQ9HAW4 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CLSPNQ9HAW4 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CLSPNQ9HAW4 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CLSPNQ9HAW4 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CLSPNQ9HAW4 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CLSPNQ9HAW4 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CLSPNQ9HAW4 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CLSPNQ9HAW4 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CLSPNQ9HAW4 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CLSPNQ9HAW4 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CLSPNQ9HAW4 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CLSPNQ9HAW4 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CLSPNQ9HAW4 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CLSPNQ9HAW4 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CLSPNQ9HAW4 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CLSPNQ9HAW4 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CLSPNQ9HAW4 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CLSPNQ9HAW4 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CLSPNQ9HAW4 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CLSPNQ9HAW4 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CLSPNQ9HAW4 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CLSPNQ9HAW4 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CLSPNQ9HAW4 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CLSPNQ9HAW4 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CLSPNQ9HAW4 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CLSPNQ9HAW4 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CLSPNQ9HAW4 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CLSPNQ9HAW4 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CLSPNQ9HAW4 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CLSPNQ9HAW4 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CLSPNQ9HAW4 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms