Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB3

SLC52A2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A2Q9HAB3 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms