Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NRDE2Q9H7Z3 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 526.2 ms