Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 AC092756.1-201ENST00000560248 448 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 Metazoa_SRP.91-201ENST00000622745 281 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 RBMS1-204ENST00000409289 1490 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 CFAP97-201ENST00000296775 903 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 AC087273.2-201ENST00000519038 634 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 PRKAA1-201ENST00000296800 1134 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 HSPB11-202ENST00000371376 765 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 MRPL47-202ENST00000392659 673 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 AP005264.6-201ENST00000592801 414 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 AC008543.2-201ENST00000436907 1383 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 LINC00704-201ENST00000430998 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 CFHR2-201ENST00000367415 1059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 LINC01752-201ENST00000417299 438 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 AC108729.1-201ENST00000487812 947 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 AL591770.1-201ENST00000554475 1131 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 OR10AE1P-201ENST00000606962 1029 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 LINC00570-201ENST00000417473 1330 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 AC135068.1-201ENST00000332663 1084 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 AC005154.1-201ENST00000434399 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 AC026355.2-201ENST00000456755 723 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 LINC00879-205ENST00000470465 757 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 AP001266.1-201ENST00000531155 1044 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 AP006295.1-201ENST00000532605 585 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 AP000919.3-201ENST00000582591 568 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 CSNK1A1-207ENST00000515768 1098 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 AC022784.5-201ENST00000522241 437 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms