Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D0

CLSTN2, Calsyntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN2Q9H4D0 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.33■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.33■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms