Protein–RNA interactions for Protein: Q9H223

EHD4, EH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4Q9H223 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms